无论使用哪种土壤处理剂，最好结合高温闷棚一块进行。蔬菜收获后，菜农一定要彻底清洁田园，将棚内蔬菜的枯枝、落叶、病果、病根等全部清出棚外，烧掉或深埋，更不要乱扔在棚前棚后，以免病菌传播。
虽然上茬蔬菜棵子拔了，但蔬菜上的病原孢子有不少落在了棚里。拔了蔬菜以后害虫没有地方呆了，也隐藏到了墙缝里、立柱上等地方，等下一茬蔬菜定植上后，一旦条件适宜，它们就对蔬菜造成危害。
建议菜农在整完地后，全棚喷洒阿维菌素混合菌核净等杀菌剂，墙体、立柱等角落都要喷到。也可将风口关闭后，使用百菌清等烟剂熏棚。
“干闷”是指作物拉秧后，不进行灌水，直接密闭大棚进行闷棚。这种方法仅能够提高地面以上局部空间温度，对杀灭土层内病菌和害虫的作用甚微，所以在实际生产中应用较少。
“干闷”仅能杀灭棚室表层的病虫，如果“干闷”与“湿闷”相结合，杀菌灭虫的效果会更彻底、更全面。
试验证明，高温闷棚结合施肥效果更好。特别是结合施用秸秆肥和石灰氮效果明显。石灰氮属于灭生性药剂，具体闷棚步骤：
威百亩也是菜农闷棚常用的灭生性药剂，具体操作如下：
❷ 先灌水至田间最大持水量的80%左右（每亩灌水量约50立方米），然后再随水冲施或滴灌威百亩，每亩用量为50kg左右，操作完成后密闭棚室进行土壤消毒。
❸ 夏季高温晴好天气20天左右即可结束闷棚，然后将通风口打开进行通风，揭掉地膜，土壤湿度合适时耕翻土壤，晾晒土壤7天左右整地定植蔬菜幼苗即可。
生产上除了威百亩、石灰氮这些灭生性药剂可以用来闷棚消毒外，也可以选择硫磺、甲基硫菌灵、噻唑膦等常规化学药剂。
如果棚室休棚时间较短，但仍需要进行土壤消毒，可以根据上茬蔬菜的发病情况，选择合适的药剂进行土壤消毒。
如上茬根结线虫病较严重，可以使用噻唑膦2kg；如上茬根腐病、枯萎病较为严重，可以选择70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1kg+77%硫酸铜钙（多宁）可湿性粉剂0.5kg，把选好的药剂均匀撒施到土壤表面，耕翻土壤混匀，再定植蔬菜幼苗。
这种土壤消毒方法不受时间限制，可以随时进行，例如可以在冬季蔬菜换茬时选择使用普通药剂消毒法，而在夏季高温季节休棚时选择石灰氮、威百亩等土壤消毒方法。
使用“日光-石灰氮”复合闷棚法对温棚土壤进行处理，能使番茄、黄瓜、辣椒根结线虫防治效果达90%左右。在蔬菜定植或缓苗后，每株（黄瓜、番茄）如能使用500~l000倍阿维菌素200mL灌根，对防治土传病害的效果还会更好。
经过高温作用，不管是有害菌还是有益菌，大部分都会被杀死。因此，高温闷棚结束后应适当增施生物菌肥或生物有机肥，以增加土壤有益菌群，保护根际环境，增强植株的抗病能力。特别需要提醒的是：生物菌肥或菌剂，一定不可在高温闷棚前施用，一定要在高温闷棚后施用。
